2001年底，国务院正式批复了由国家环保总局牵头编制的《三峡库区及其上游水污染防治规划（2001—2010年）》。此后的10年，国家将投资392．2亿元进行综合治理。2010年，库区及其上游主要控制断面水质，将基本达到国家地表水环境质量二类标准。