16日19时59分，中国航天员科研训练中心主任陈善广与两位航天员通话。陈善广说：“这几天，我们收到全国各界群众和世界各地同胞的来电，向你们表达亲切的问候和祝愿，期盼你们平安归来。”“感谢全国人民，感谢台湾同胞、港澳同胞、海外侨胞对我们的关心和厚爱。”聂海胜雄浑的声音，从距离地面343公里的太空传来。
17日凌晨，位于内蒙古四子王旗阿木古朗牧场的主着陆场星光灿烂。这是一段令人焦急的时光，飞船在航行了325万公里之后，正沿着既定的返回轨迹，飞向祖国的怀抱。
4时08分，喀什测控站发现目标，飞船飞入祖国上空。一朵“彩云”出现在广阔的草原上，在1200平方米的主降落伞牵引下，飞船缓缓向预定着陆点飘落。飞船距离地面1米时，反推发动机精确点火。返回舱的速度由8米每秒迅速下降到1米每秒，如同一片羽毛，轻轻地落在草原上。4时33分，飞船返回舱着陆，航天员报告身体感觉良好。
北京飞行控制中心里掌声四起。费俊龙的父亲费长宝由衷地赞叹：“祖国真伟大！”
5时38分，身着航天服的费俊龙自主出舱，聂海胜随后走出，挥动鲜花向搜救人员致意，欢呼声惊醒了草原的黎明。
这一刻，距离神舟六号发射115个小时又32分钟；距杨利伟完成中国首次载人航天飞行后顺利返回两年又22个小时；距离中国载人航天工程启动13年又26天。
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神六在我国航天史上创下的诸多“第一”
第一次多人太空飞行
神舟六号此次出征搭乘两名航天员。
第一次多天飞行
费俊龙、聂海胜目前是中国日行最远、在太空中生活时间最长的人。
第一次在太空穿脱压力服
太空旅行第一天，航天员第一次“解放”了自己。
第一次进入轨道舱
两名航天员第一次从返回舱进入轨道舱。
第一次细胞搭载实验
10月16日上午，航天员在轨道舱进行了我国首次细胞搭载实验。
第一次吃热食和复水食品
航天员的太空食谱有50多种，都是真空包装，航天员可以通过加热、注水吃上新鲜的食品。
第一次用太空马桶
由于神六要在太空旅行多天，神六上装备了特制的太空马桶。
第一次自测血压
费俊龙从衣服的“胳膊包”里取出了特制血压计，自行测量了一下血压，一切正常。
第一次“在轨干扰力”试验
“在轨干扰力”试验包括开关舱门、穿脱压力服、穿舱、抽取冷凝水四大项。完成之后,航天员可自由进行类似幅度动作。
第一个太空生日
聂海胜在亿万人的祝福下，以奇妙的太空生活度过了他的41岁生日。
第一次在太空刮胡子
费俊龙先给胡须涂上了特殊的剃须膏，然后拿着剃须刀开始刮。刮完以后，费俊龙对着镜子露出很满意的神情。
第一个太空前空翻
费俊龙在舱内连做了4个前翻滚，用时约3分钟。以飞船飞行速度计算，费俊龙一个“筋斗”就飞了约351公里。
第一次有人参与空间实验
神舟六号上进行的实验是中国第一次有人参与的空间科学实验。人的参与将使空间科学试验实现质的飞跃。
第一次改进座椅着陆缓冲功能
神舟六号第一次改进了座椅的着陆缓冲功能，不仅保护了航天员，还能让航天员在返回途中座椅提升时仍然可以看到舷窗外的情况。
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