1987年世界自然保护联盟（IUCN）专门开设了植物园保护秘书处（BGCS），并于同年开始在世界范围内建立植物园会员关系，并开展一些支援植物园发展的项目活动。1989年，植物园保护秘书处与世界自然保护联盟、世界自然基金会（WWF）制定了《植物园保护策略》这一纲领性文件。次年，植物园保护秘书处正式从世界自然保护联盟中独立出来并更名为植物园保护国际（BGCI）而逐渐为世人所知。BGCI在英国获得威尔士亲王陛下及其皇室成员的赞助。同时BGCI还获得了邱园皇家植物园及爱丁堡皇家植物园的赞助。除了总部设在英国邱园以外，BGCI还在美国、俄罗斯设有基金会，并在中国、哥伦比亚、印度尼西亚、荷兰和西班牙设有地区办事处。到目前为止，BGCI已经拥有遍布世界100多个国家的500多个植物园成员，一个立足核心地区遍布全世界的植物园保护网络基本建成。