862年1月1日，清政府总理衙门批准设立江汉关。

1922年11月4日，江汉关大楼举行奠基典礼。经过一年多的建设，于1924年1月21日举行落成典礼。

1930年，因岳州口岸贸易缩减，原岳州分关事务由江汉关办理。

1937年，长沙关撤销，所有未了事务及人员由江汉关办理。

1938年10月25日，武汉被日本侵略军占领，江汉关停止工作。

1945年8月10日，日本宣布投降后，江汉关于1945年9月26日恢复海关业务。

1949年5月26日，武汉市军事管制委员会海关贸易处接管江汉关。

1949年10月25日中央人民政府海关总署成立，江汉关直属海关总署领导。

1950年1月15日，江汉关改称中华人民共和国汉口关。

1950年10月16日，汉口关改名为武汉关。

1953年1月15日，改称中华人民共和国武汉关。

1956年，由于当时我国对外贸易形势发生变化，武汉关于5月1日奉令对外公告撤销。

1980年3月28日，经国务院批准，武汉海关正式成立。

1984年6月9日，国务院批准武汉海关调整为厅局级机构。