在新一轮机构改革中，国务院组成部门的改革重点将依然是三个方面：一是对具有经济调节和市场监管职能的部门进行改革，加强宏观调控，减少微观干预；二是对具有公共服务职能的部门进行改革，通过机构改革促进事业单位改革；三是对国有企业进行改革，为市场经济的进一步发展创造良好的竞争环境。
毛寿龙等人近日完成了一份关于政府机构改革的课题报告。该报告建议，大部门体制改革可分两个阶段进行，2008年小范围试点大部制，在交通和农业等领域试点，总结经验教训；然后在事业单位改革逐步推进的基础上，推进公共服务领域的机构改革。2013年在巩固以往改革成果基础上，进一步进行政治、职能和组织层面的改革。
1982年至今，我国先后进行过五次大的行政管理体制改革。1982年国务院100个部门裁了39个；1988年，国务院组成部门、直属机构由原有的67个减为60个，国务院人员编制比原来减少了9700多人；1993年国务院组成部门、直属机构从原有的86个减少到59个，人员减少20%；1998年，国务院的40个组成部门，仅保留29个；2003年设立国务院国资委、银监会，组建商务部、国家食品药品监督管理局。
