华中科技大学共设有46个院系。

　　机械科学与工程学院 、计算机科学与技术学院 、生命科学与技术学院电气与电子工程学院 、材料科学与工程学院 、船舶与海洋工程学院能源与动力工程学院 、自动化学院、光学与电子信息学院水电与数字化工程学院、软件学院、环境科学与工程学院电子与信息工程系、建筑与城市规划学院、土木工程与力学学院化学与化工学院、数学与统计学院、物理学院公共管理学院 、经济学院、管理学院人文学院、哲学系、 中文系新闻与信息传播学院、马克思主义学院、社会学系法学院、外国语学院 、基础医学院药学院 、医药卫生管理学院 、公共卫生学院法医学系、 护理学系、计划生育研究所第一临床学院、第二临床学院 、第三临床学院教育科学研究院、国际教育学院、历史研究所国学研究院、体育部、中欧清洁与可再生能源学院远程与继续教育学院